液相色谱仪的分离系统是比较简单的，它包括色谱柱和连接管以及恒温器，这三个设备都是缺一不可的，如果缺少了其中的某个设备的话就可能会产生非常麻烦的后果。一般色谱柱的长度是不超过50cm的，内径统一为2cm到5cm，材质也有不同的类型，比如不锈钢的和钛合金的，这三种不同类型的液相色谱仪在使用的时候会有不同的效果。在色谱柱的内部有固定相，这个固定相也是色谱仪中不能缺少的零件，它有着高强度的树脂和硅胶，而且它的惰性非常强，如果加入机械涂渍的话会产生不同的化合物，在分离蛋白的时候能够起到非常好的效果。
　　在进行分离的时候液相色谱仪会起到非常关键的效果，不同材质的物品在分离的时候效果是*不同的，有的效果会稍微好一些，有的可能需要较长的时间才能够*分离，所以大家在分离的时候一定要有耐心，不然就会无法等到它*分离了。在了解固定相的时候我们会发现它的柱床是非常均匀的，内部的结构也很紧密，这样很容易降低涡流的扩散效应。在进行传输的时候也证明了基质的粒度越小，那么分辨率就会越高，在使用的时候大家可以去观察一下，看看你它的运作过程到底是怎样的，在其中分离系统又发挥着怎样的作用，了解之后你就可以得出结果了。